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| 聖保羅教堂位於山丘上視野良好，衝破雲層的日光彷彿神蹟般的光束，就投射在馬六甲 |
小教堂由葡萄牙貴族杜阿爾特科埃略建於1521年，以感激聖母保佑他逃脫了南中國海的風暴，最初的建築是一個簡單的小教堂，供奉聖母，稱為Nossa Senhora da Annunciada（恩寵聖母）或Nossa Senhora da Annunciada（山上聖母）。1548年，果阿主教將小教堂給了耶穌會。小教堂更名為天主之母堂（Igreja de Madre de Deus）。同年，聖方濟·沙勿略在此設立了一所學校。這也許是馬來半島現代意義上的第一所學校。聖方濟·沙勿略將此教堂作為他前往中國和日本傳教之旅的 基地。在一次旅行中，14年後，聖方濟因進不了中國在上川島染瘧疾去世。十週後，為移葬棺柩從土裏掘出，發現遺體完整不腐。運回該教堂暫時安葬，不久，又 遷葬果阿耶穌堂，留存空墓在此。據說，遺體數百年來都沒腐壞，1662年沙勿略被教會列為聖徒，他的墓地也成為朝拜的聖地。同時，馬六甲、羅馬和澳門聖若 瑟修院都藏著沙勿略的部份遺體。在臺北內湖的方濟中學亦即是為紀念他而命名。
